依據《中華民國憲法》規定,《國防法》應為一切有關國防法令的母法,然而中華民國政府自1947年開始研擬制定國防組織法之後,經過53年的延宕,方於2000年制定完成。造成立法延宕的主因有二,其一在於因受憲政體制的行政雙元結構的影響,導致國防軍政軍令系統的雙元結構,其二則是由於總統的憲法定位曖昧不明。而自第四次修憲以後,中華民國的憲政體制由原先憲法規定的修正式內閣制轉變為半總統制,具有實權的雙頭行政首長分別掌控國防組織的軍政與軍令。是故國防法雖於2000年1月制定完成,並號稱從此軍政軍令歸於一元,但在半總統制下實際上的雙元行政權是否真的能做到軍政軍令的一元化,即為本文所探討的重心所在。