政府機關辦理軌道運輸系統建設採購時，考量採購機關本身具備之技術及管理人力及能力，近年來有採統包方式辦理招標之趨勢；而以統包方式辦理之採購案，雖然有提升採購效率、確保採購品質、縮短工期且可節省經費的普遍認知，但是實際上仍面臨許多不同的難題，如估驗計價方式、契約變更基準、替代方案執行可行性、關聯標案設計界面之因應措施與招標文件功能規範訂定之程度（功能導向或材料細部要求），以及發包模式與招標策略等；以上相關統包工程執行上常產生之難題，除了涉及相關契約文件之訂定外，更與辦理採購時決定採何種統包方式辦理、統包工程採購本質、特性、規模及分標模式、招標策略等息息相關，如軌道運輸系統採統包工程辦理採購，係採土建與機電系統併標辦理之統包工程，或土建與機電系統分標辦理之統包工程，在招標策略上為首要之決策，必須考量後續軌道運輸系統統包工程在執行上業主與廠商間權利義務的權重配當，才能避免未來執行的履約爭議，或將履約爭議的影響降至最低。