SARS讓全國醫療和防疫體系受到極大衝擊，政府部門針對原有的感染管制措施進行檢視，並訂定醫療機構執行感染管制措施查核辦法，2005年起開始辦理全國醫院感染管制查核普查作業；透過由各縣市衛生局負責轄區內醫院查核及督導改善等業務，訂定標準化作業流程，期能提升醫界對感染管制之重視，保障病人就醫安全。在後SARS時代，臺灣累積相關經驗並推動許多防治策略，與全球共同面對新興高傳染性高致死性病毒、醫療照護相關感染及全球抗藥性危機等，唯有正視感染管制的核心問題，並採取行動尋找解決方法，才能讓問題獲得改善。
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