民國三十八年一月二十日，傅斯年出任臺灣大學校長，到民國三十九年十二月二十日病逝為止，這是傅斯年一生中最後的重要抉擇。這件事具有工作挑戰與艱困時局的雙重考驗。但他最後毅然受命，決心一力承擔，充分表現其臨危不避的精神。傅斯年對我國教育文化發展十分關心，加以見聞廣博、觀察力敏銳，因此對教育問題，尤其是高等教育，頗有獨到且深入的看法。臺灣大學源自日據時代的臺北帝大，基本上是實行傅先生最欣賞的歐洲正統大學的講座制，表現出強烈的研究取向。但在面對不斷擴張的學生人數，尤其是要從三年制的講座式大學轉變成四年學分制的美式大學制度，導致大一共同課程所需的大教室、實驗室及圖書儀器設備等嚴重不足，逼得他不得不在艱困的環境中優先充實這方面的設備。為能逐步恢復臺大的研究功能，他從大一各科基本課程的教學著手，同時更措意於師資之改善。傅先生出掌臺大後，走的是迂迴的路，先從加強教育的功能著手，再圖研究發展的進展，與他早期對大學的理想頗有不同。傅先生七百天的臺大校長工作便是在現實逼迫下，勉力朝其理想盡心奮鬥。除了大學本身事務外，傅先生還背負著自光復以來未上軌道的外在環境，以及大陸易手後如排山倒海而來的種種問題。這些都要原僅身負臺大之責的傅校長來承擔。以下三大問題都是這些負擔的具體表現，包括：一、整修破校舍、安頓窮學生。二、處理學潮、安定校園。三、問題叢生的臺大醫院。在如此紛擾的現實中，傅校長仍拖著蹣跚的步伐朝他辦學的理想邁進。以下兩方面就是明證：一、常規的建立。二、校風的提振。孟真先生來臺後，是以亂世餘生的心情，拼命為臺大做事。任臺大校長的他，在那個風兩如晦的漫天歲月，的確發揮了道義力量的最高境界！他給臺大留下的，是傅斯年精神！